Ens remontam a l’any 1978 per conèixer els orígens del nostre centre. Se sap que a Cala Rajada ja funcionava una aula de la qual el mestre era Don Vicenç Nadal. Al setembre de l’any 78 un grup de pares, el rector i ses monges de Cala Rajada, varen sol·licitar una escola a la Delegació del MEC. Ses monges varen habilitar 2 classes de les seves dependències per a alumnes de 4 i 5 anys, ja independents de Capdepera, de les quals varen ser mestres i directores na Mª Antònia Tous i na Mª Antònia Ballester. El curs 79-80 varen passar al local de s’Auba Vell (antiga biblioteca) i arribaren a cursar 1r i 2n d’EGB.
El col·legi a l’avinguda Floreal va ser inaugurat el curs 85-86, exactament l’any 1985. El director era D. Luís López. Va començar amb una línia, més endavant s’amplià a 2 línies i la darrera ampliació va tenir lloc al 2006, en què es completà l’edifici d’E. Infantil.
Al llarg dels anys els diferents directors que ha tengut s’Auba han estat: D. Andrés García, D. Isidré Boné Gullen, D. Daniel Bosch Badenes, D. Francesc Fuster Pons, D. Francesc Barbón Juan, D. Antònia Tur Balaguer i l’actual, Joan Jofre Llabrés .
El centre s’ha anat bastint dia rere dia amb l’esforç, el treball, la participació i la il·lusió de moltes persones: alumnes, pares, mestres… Al llarg de tots aquests anys s’ha anat forjant el tarannà de l’escola, que està al servei de la comunitat i pretén educar els infants tant en la seva vessant personal com acadèmica.